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抗體一直是件勞心勞力的事情。搜索比較，查找文獻(xiàn)，還不一定可靠。如今，一個(gè)新的數(shù)據(jù)庫(kù)也許能消除你的煩惱。這個(gè)名為Histone Antibody Specificity Database的網(wǎng)站提供了經(jīng)過驗(yàn)證的檢測(cè)結(jié)果，讓研究人員能夠獲得和比較真實(shí)世界的數(shù)據(jù)，并挑選*可靠的抗體。近日，一篇發(fā)表在《Molecular Cell》上的文章介紹了這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)。
“我無法想象有任何生物醫(yī)學(xué)研究不依賴抗體；它們通常是許多研究中的關(guān)鍵，”北卡羅萊納大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Brian D. Strahl教授談道，他也是這篇文章的通訊作者。“但是，這些工具有多可靠？生物界逐漸認(rèn)識(shí)到，我們需要更好的方式來了解抗體。這也是我們建立這個(gè)網(wǎng)站的目的。”
這個(gè)網(wǎng)站主要關(guān)注組
蛋白的抗體，這屬于新興的表觀遺傳學(xué)研究領(lǐng)域的一部分。表觀遺傳學(xué)研究人員研究基因組外的信息如何控制基因的“開”和“關(guān)”，就像電燈開關(guān)一樣，這反過來又影響人類健康的方方面面。研究人員利用組蛋白抗體來追蹤各種蛋白在基因調(diào)控中的作用。
每個(gè)組蛋白抗體被認(rèn)為與特定的蛋白目標(biāo)結(jié)合，讓科學(xué)家能夠追蹤健康和患病
細(xì)胞中的蛋白如何被調(diào)節(jié)。然而，人們也發(fā)現(xiàn)，一些抗體與主要目標(biāo)之外的其他蛋白結(jié)合，而一些抗體雖只與一個(gè)蛋白結(jié)合，但并非理想中的目標(biāo)。在某些情況下，抗體的準(zhǔn)確性和特異性隨批次而變化，表明質(zhì)量控制存在問題。
新的數(shù)據(jù)庫(kù)提供了100多種常用的組蛋白抗體的準(zhǔn)確性和特異性的信息。它所使用的檢測(cè)方法是基于Strahl及其同事開發(fā)的肽段芯片。此芯片呈現(xiàn)了組蛋白上已知的所有化學(xué)修飾或“標(biāo)簽”。通過分析，他們能迅速弄清每個(gè)抗體能與哪種類型的標(biāo)簽結(jié)合。這相當(dāng)重要。每個(gè)標(biāo)簽被認(rèn)為具有不同的功能。
肽段芯片平臺(tái)的消息傳出去之后，Strahl及其同事就經(jīng)常接到其他科學(xué)家的電話，咨詢?nèi)绾芜x擇抗體。這激起了研究小組的想法：何不購(gòu)買所有常用的組蛋白抗體，在芯片上檢驗(yàn)它們，并在一個(gè)網(wǎng)站上公布結(jié)果？
這個(gè)網(wǎng)站允許用戶利用多個(gè)參數(shù)搜索抗體。Strahl表示，他希望此數(shù)據(jù)庫(kù)能夠帶來更準(zhǔn)確、更具重復(fù)性的表觀遺傳學(xué)成果。“你不要指望每個(gè)抗體都是完美的，但我們希望研究人員能知道它的缺陷是什么，”Strahl說。“這樣，至少人們能夠謹(jǐn)慎地解釋他們的結(jié)果。
原創(chuàng)作者：上海遠(yuǎn)慕生物科技有限公司
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